虽然Android Studio 此时已经更新到了Android Studio 2.1版本，build 版本android-studio-bundle-143.2739321。但是在安装该版本都是根据自己的标准进行安装，所以需要在安装之后进行一系列的调整。下面文章根据3个方面进行讲解。分别为Android Studio本身、Gradle、不调整出现的编译上的问题。

Android Studio优化

编译优化需要有两个步骤，以下一一介绍。

步骤一：Gradle编译优化

在项目的根目录中进行修改。修改gradle.properties，

gradle.properties 该文件的位置（H/gradle.properties）

Project-wide Gradle settings. 
IDE (e.g. Android Studio) users: 
Gradle settings configured through the IDE will override 
any settings specified in this file.

For more details on how to configure your build environment visit 
http://www.gradle.org/docs/current/userguide/build_environment.html

Specifies the JVM arguments used for the daemon process. 
The setting is particularly useful for tweaking memory settings. 
Default value: -Xmx10248m -XX:MaxPermSize=256m 
org.gradle.jvmargs=-Xmx2048m -XX:MaxPermSize=512m -XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError -Dfile.encoding=UTF-8

When configured, Gradle will run in incubating parallel mode. 
This option should only be used with decoupled projects. More details, visit 
http://www.gradle.org/docs/current/userguide/multi_project_builds.html#sec:decoupled_projects 
org.gradle.parallel=true

根据该文件的描述，我的设置为：

org.gradle.jvmargs=-Xmx3062m -XX:MaxPermSize=512m -XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError -Dfile.encoding=UTF-8 
org.gradle.parallel=true 
org.gradle.daemon=true

名词解释 
这里可以参考： 
http://www.cnblogs.com/mingforyou/archive/2012/03/03/2378143.html 
- org.gradle.jvmargs ：JVM 内存管理，存在于堆上。在这里可以理解为Gradle的内存管理 
- -Xms ： 初始分配的内存由-Xms指定，堆内存。 
- -Xmx ： 最大分配的内存由-Xmx指定，堆内存。 
- -XX:PermSiz:JVM使用-XX:PermSize设置非堆内存初始值 
- -XX:MaxPermSize设置最大非堆内存的大小 
- org.gradle.daemon=true 
- org.gradle.parallel=true

步骤二：Android Studio 优化

找到Android Studio安装目录。 
我的安装目录在F:\Android\AndroidStudio\Soft\bin 
在这个文件 gradle.properties

-server 
-Xms512m 
-Xmx2048m 
-XX:MaxPermSize=350m 
-XX:ReservedCodeCacheSize=240m 
-XX:+UseConcMarkSweepGC 
-XX:SoftRefLRUPolicyMSPerMB=50 
-da 
-Djna.nosys=true 
-Djna.boot.library.path=

-Djna.debug_load=true 
-Djna.debug_load.jna=true 
-Dsun.io.useCanonCaches=false 
-Djava.net.preferIPv4Stack=true 
-XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError 
-Didea.paths.selector=AndroidStudio2.1 
-Didea.platform.prefix=AndroidStudio

从这个文件中，可以根据上面上面的名词解释中进行理解性修改。上面是我自己的设置。

优化前 - 存在的问题

transformClassesWithDexForDebug

1. Error:Execution failed for task ‘:app:transformClassesWithDexForDebug’. 
   com.android.build.api.transform.TransformException: com.android.ide.common.process.ProcessException: java.util.concurrent.ExecutionException: com.android.ide.common.process.ProcessException: org.gradle.process.internal.ExecException: Process ‘command ‘C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_77\bin\java.exe” finished with non-zero exit value 3
2. Error:UNEXPECTED TOP-LEVEL ERROR:
3. Error:java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded
4. For faster builds, increase the maximum heap size for the Gradle daemon to more than 2048 MB. 
   To do this set org.gradle.jvmargs=-Xmx2048M in the project gradle.properties. 
   For more information see https://docs.gradle.org/current/userguide/build_environment.html

原因

在使用Gradle编译的时候，编译内存不足导致。

解决方法

在项目的根目录中进行修改。修改gradle.properties， 
set org.gradle.jvmargs=-Xmx2048M。 
修改后该问题得已解决。