本文详细总结了PHP网站在Linux服务器上面的安全配置，包含PHP安全、mysql数据库安全、web服务器安全、木马查杀和防范等，很好很强大很安全。(如果需要深入的安全部署建议找专业做安全的国内公司如：Sinesafe,绿盟,启明星辰等等都是比较不错的专业做网站安全的公司)
PHP安全配置
1. 确保运行php的用户为一般用户，如www
2. php.ini参数设置
disable_functions = passthru,exec,system,chroot,chgrp,chown,shell_exec,proc_open,proc_get_status,ini_alter,ini_restore,dl,openlog,syslog,readlink,symlink,popepassthru,stream_socket_server,fsocket,phpinfo #禁用的函数
expose_php = off #避免暴露PHP信息
display_errors = off #关闭错误信息提示
register_globals = off #关闭全局变量
enable_dl = off #不允许调用dl
allow_url_include = off #避免远程调用文件
session.cookie_httponly = 1 #http only开启
upload_tmp_dir = /tmp#明确定义upload目录
open_basedir = ./:/tmp:/home/wwwroot/#限制用户访问的目录
open_basedir参数详解
open_basedir可将用户访问文件的活动范围限制在指定的区域，通常是其家目录的路径，也可用符号"."来代表当前目录。注意用open_basedir指定的限制实际上是前缀,而不是目录名。
举例来说: 若"open_basedir = /home/wwwroot", 那么目录"/home/wwwroot"和"/home/wwwroot1"都是可以访问的。所以如果要将访问限制在仅为指定的目录，请用斜线结束路径名。
注意：
从网上获取的资料来看，open_basedir会对php操作io的性能产生很大的影响。研究资料表明，配置了php_basedir的脚本io执行速度会比没有配置的慢10倍甚至更多，请大家自己衡量
open_basedir也可以同时设置多个目录, 在Windows中用分号分隔目录,在任何其它系统中用冒号分隔目录。当其作用于Apache模块时，父目录中的open_basedir路径自动被继承。
MySQL安全设置
1. MySQL版本的选择
在正式生产环境中，禁止使用4.1系列的MySQL数据库。至少需要使用5.1.39或以上版本。
2. 网络和端口的配置
在数据库只需供本机使用的情况下，使用–skip-networking参数禁止监听网络 。
3. 确保运行MySQL的用户为一般用户，如mysql，注意存放数据目录权限为mysql
vi/etc/my.cnf
user = mysql
4. 开启mysql二进制日志，在误删除数据的情况下，可以通过二进制日志恢复到某个时间点
vi/etc/my.cnf
log_bin = mysql-bin
expire_logs_days = 7
5. 认证和授权
(1) 禁止root账号从网络访问数据库，root账号只允许来自本地主机的登陆。
mysql>grantallprivilegeson*.* toroot @localhost identified by'password'withgrantoption;
mysql>flush priveleges;
(2) 删除匿名账号和空口令账号
mysql>USE mysql;
mysql>deletefromuserwhereUser=;
mysql>deletefromuserwherePassword=;
mysql>deletefromdb whereUser=;
web服务器安全
确保运行Nginx或者Apache的用户为一般用户，如www，注意存放数据目录权限为www
防止sql注入
if( $query_string ~* ".*[\;'\<\>].*"){
return404;
}
关闭存放数据上传等目录的PHP解析
location ~* ^/(attachments|data)/.*\.(php|php5)${
deny all;
}
针对Apache：关闭图片目录/上传等目录的PHP解析
order allow,deny
Deny from all
木马查杀和防范
php木马快速查找命令
grep-r --include=*.php '[^a-z]eval($_POST'/home/wwwroot/
grep-r --include=*.php 'file_put_contents(.*$_POST\[.*\]);'/home/wwwroot/
利用find mtime查找最近两天或者发现木马的这几天，有哪些PHP文件被修改
find-mtime -2 -typef -name \*.php
防范：
1. 做好之前的安全措施，比如禁用相关PHP函数等
2. 改变目录和文件属性
find-typef -name \*.php -execchomd 644 {} \;
find-typed -execchmod755 {} \;
chown-R www.www /home/wwwroot/www.waitalone.cn
3. 为防止跨站感染，需要做虚拟主机目录隔离
(1) nginx的简单实现方法
利用nginx跑多个虚拟主机，习惯的php.ini的open_basedir配置：
open_basedir = ./:tmp:/home/wwwroot/
注：/home/wwwroot/是放置所有虚拟主机的web路径
黑客可以利用任何一个站点的webshell进入到/home/wwwroot/目录下的任何地方，这样对各个虚拟主机的危害就很大
例如： /data/www/wwwroot目录下有2个虚拟主机
修改php.ini
open_basedir = ./:/tmp:/home/wwwroot/www.sinesafe.com:/home/wwwroot/back.sinesafe.com
这样用户上传webshell就无法跨目录访问了。
(2) Apache的实现方法，控制跨目录访问
在虚拟机主机配置文件中加入
php_admin_value open_basedir "/tmp:/home/wwwroot/www.sinesafe.com"