private void NewWindowHandler(object sender, RoutedEventArgs e)
{       
    Thread newWindowThread = new Thread(new ThreadStart(ThreadStartingPoint));
    newWindowThread.SetApartmentState(ApartmentState.STA);
    newWindowThread.IsBackground = true;
    newWindowThread.Start();
}

private void ThreadStartingPoint()
{
    Window1 tempWindow = new Window1();
    tempWindow.Show();       
    System.Windows.Threading.Dispatcher.Run();
}

编辑: 这是一个旧的答案，但是由于它似乎经常被访问，因此我还可以想到以下修改/改进(未经测试).

如果您想关闭这样的窗口，只需从线程外部(委托)保留对Window对象的引用，然后在其上调用close，如下所示:

void CloseWindowSafe(Window w)
{
    if (w.Dispatcher.CheckAccess())
        w.Close();
    else
        w.Dispatcher.Invoke(DispatcherPriority.Normal, new ThreadStart(w.Close));
}

// ...
CloseWindowSafe(tempWindow);

如果新线程可能被终止(强制中止)，则符合注释中的问题:

private void ThreadStartingPoint()
{
    try{
        Window1 tempWindow = new Window1();
        tempWindow.Show();       
        System.Windows.Threading.Dispatcher.Run();
    }
    catch(ThreadAbortException)
    {
        tempWindow.Close();
        System.Windows.Threading.Dispatcher.InvokeShutdown();
    }
    //the CLR will "rethrow" thread abort exception automatically
}

中止线程(几乎总是)是违反最佳实践的.应该通过各种同步技术中的任何一种来优雅地处理线程，或者在这种情况下，只需通过调用的window.Close()