64位的操作系统安装成功后，一般IIS也是默认的64位的解析，所以将程序放到64位操作系统上的时候，会出现IIS错误，解决方案也非常简单，将64位IIS停止，启动32位的就可以了。
输入以下命令启用 32 位模式：
cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 1
运行.net环境，重新注册一下（这个是1.1版本的，如果是2.0或者4.0请修改下面的语句）
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework\v1.1.4322\aspnet_regiis.exe -i
或者参考文章：http://support.microsoft.com/kb/894435
还有一些其他的解决方案，是网友提供的，仅供参考
在iis管理->应用程序池->高级设置->启用32位应用程序 设为true
IIS中选择网站右键属性找到应用程序配置将映射中找到.aspx扩展名将Framework64位改为Framework32位的
目录为C:\Windows\Microsoft.NET\Framework64\……
改成C:\Windows\Microsoft.NET\Framework\……
在windows x64的2003上，部署了x32 x64混合的IIS 6,
当安装好了.net 3.0 x64后，开启asp 2.0， 再安装SPS出，出错，好象出现非纯32位系统的提示，
当我使用cd C:\Inetpub\AdminScripts ; cscript.exe adsutil.vbs set W3SVC/AppPools/Enable32BitAppOnWin64 "false",即关闭32位应用程序后，就能顺利安装sps,当安装SPS过了检测系统环境后，再执行cscript.exe adsutil.vbs set W3SVC/AppPools/Enable32BitAppOnWin64 "true",继续安装，安装完SPS并配置好后，打开SPS 3.0管理中心，出现：“%1 不是有效的 Win32 应用程序。 ”，若再次执行cscript.exe adsutil.vbs set W3SVC/AppPools/Enable32BitAppOnWin64 "false",就会出现Service Unavailable，当我使用cd C:\Inetpub\AdminScripts ; cscript.exe adsutil.vbs set W3SVC/AppPools/Enable32BitAppOnWin64 "false",即关闭32位应用程序后,SPS3.0管理中心能正常访问。
现在的问题是，如何能保存32位的IIS6环境下，让SPS能正常访问？请大家帮助解决，谢谢
ASP.NET 1.1，32 位版本
要运行 32 位版本的 ASP.NET 1.1，按照以下步骤操作：
1.单击“开始”，单击“运行”，键入 cmd，然后单击“确定”。
2.键入以下命令启用 32 位模式：
cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 13.键入以下命令，安装 ASP.NET 1.1 版本并在 IIS 根目录下安装脚本映射：
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework\v1.1.4322\aspnet_regiis.exe -i4.确保在 Internet 信息服务管理器的 Web 服务扩展列表中，将 ASP.NET 版本 1.1.4322 的状态设置为允许。
ASP.NET 2.0，32 位版本
要运行 32 位版本的 ASP.NET 2.0，请按照以下步骤操作：
1.单击“开始”，单击“运行”，键入 cmd，然后单击“确定”。
2.键入以下命令启用 32 位模式：
cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 13.键入以下命令，安装 ASP.NET 2.0（32 位）版本并在 IIS 根目录下安装脚本映射：
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework\v2.0.40607\aspnet_regiis.exe -i4.确保在 Internet 信息服务管理器的 Web 服务扩展列表中，将 ASP.NET 版本 2.0.40607（32 位）的状态设置为允许。
ASP.NET 2.0，64 位版本
要运行 64 位版本的 ASP.NET 2.0，请按照以下步骤操作：
1.单击“开始”，单击“运行”，键入 cmd，然后单击“确定”。
2.键入以下命令禁用 32 位模式：
cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 03.键入以下命令，安装 ASP.NET 2.0 版本并在 IIS 根目录下安装脚本映射：
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework64\v2.0.40607\aspnet_regiis.exe -i4.确保在 Internet 信息服务管理器的 Web 服务扩展列表中，将 ASP.NET 版本 2.0.40607 的状态设置为允许。
注意：ASP.NET 2.0 的内部版本可能随当前发行的内部版本的变化而变化。这些步骤适用于内部版本 2.0.40607。