Python 读取图像文件的性能对比

Python 读取图像文件的性能对比

使用 Python 读取一个保存在本地硬盘上的视频文件,视频文件的编码方式是使用的原始的 RGBA 格式写入的,即无压缩的原始视频文件。最开始直接使用 Python 对读取到的文件数据进行处理,然后显示在 Matplotlib 窗口上,后来发现视频播放的速度比同样的处理逻辑的 C++ 代码慢了很多,尝试了不同的方法,最终实现了在 Python 中读取并显示视频文件,帧率能够达到 120 FPS 以上。

读取一帧图片数据并显示在窗口上

最简单的方法是直接在 Python 中读取文件,然后逐像素的分配 RGB 值到窗口中,最开始使用的是 matplotlib 的 pyplot 组件。

一些用到的常量:

FILE_NAME = "I:/video.dat"
WIDTH = 2096
HEIGHT = 150
CHANNELS = 4
PACK_SIZE = WIDTH * HEIGHT * CHANNELS

每帧图片的宽度是 2096 个像素,高度是 150 个像素,CHANNELS 指的是 RGBA 四个通道,因此 PACK_SIZE 的大小就是一副图片占用空间的字节数。

首先需要读取文件。由于视频编码没有任何压缩处理,大概 70s 的视频(每帧约占 1.2M 空间,每秒 60 帧)占用达 4Gb 的空间,所以我们不能直接将整个文件读取到内存中,借助 Python functools 提供的 partial 方法,我们可以每次从文件中读取一小部分数据,将 partial 用 iter 包装起来,变成可迭代的对象,每次读取一帧图片后,使用 next 读取下一帧的数据,接下来先用这个方法将保存在文件中的一帧数据读取显示在窗口中。

with open( file, 'rb') as f:
e1 = cv.getTickCount()
records = iter( partial( f.read, PACK_SIZE), b'' ) # 生成一个 iterator
frame = next( records ) # 读取一帧数据
img = np.zeros( ( HEIGHT, WIDTH, CHANNELS ), dtype = np.uint8)
for y in range(0, HEIGHT):
for x in range( 0, WIDTH ):
pos = (y * WIDTH + x) * CHANNELS
for i in range( 0, CHANNELS - 1 ):
img[y][x][i] = frame[ pos + i ]
img[y][x][3] = 255
plt.imshow( img )
plt.tight_layout()
plt.subplots_adjust(left=0, right=1, top=1, bottom=0)
plt.xticks([])
plt.yticks([])
e2 = cv.getTickCount()
elapsed = ( e2 - e1 ) / cv.getTickFrequency()
print("Time Used: ", elapsed )
plt.show()

需要说明的是,在保存文件时第 4 个通道保存的是透明度,因此值为 0,但在 matplotlib (包括 opencv)的窗口中显示时第 4 个通道保存的一般是不透明度。我将第 4 个通道直接赋值成 255,以便能够正常显示图片。

这样就可以在我们的窗口中显示一张图片了,不过由于图片的宽长比不协调,使用 matplotlib 绘制出来的窗口必须要缩放到很大才可以让图片显示的比较清楚。

为了方便稍后的性能比较,这里统一使用 opencv 提供的 getTickCount 方法测量用时。可以从控制台中看到显示一张图片,从读取文件到最终显示大概要用 1.21s 的时间。如果我们只测量三层嵌套循环的用时,可以发现有 0.8s 的时间都浪费在循环上了。

Python 读取图像文件的性能对比

读取并显示一帧图片用时 1.21s

Python 读取图像文件的性能对比

在处理循环上用时 0.8s

约百万级别的循环处理,同样的代码放在 C++ 里面性能完全没有问题,在 Python 中执行起来就不一样了。在 Python 中这样的处理速度最多就 1.2 fps。我们暂时不考虑其他方法进行优化,而是将多帧图片动态的显示在窗口上,达到播放视频的效果。

连续读取图片并显示

这时我们继续读取文件并显示在窗口上,为了能够动态的显示图片,我们可以使用 matplotlib.animation 动态显示图片,之前的程序需要进行相应的改动:

fig = plt.figure()
ax1 = fig.add_subplot(1, 1, 1)
try:
img = np.zeros( ( HEIGHT, WIDTH, CHANNELS ), dtype = np.uint8)
f = open( FILE_NAME, 'rb' )
records = iter( partial( f.read, PACK_SIZE ), b'' ) def animateFromData(i):
e1 = cv.getTickCount()
frame = next( records ) # drop a line data
for y in range( 0, HEIGHT ):
for x in range( 0, WIDTH ):
pos = (y * WIDTH + x) * CHANNELS
for i in range( 0, CHANNELS - 1 ):
img[y][x][i] = frame[ pos + i]
img[y][x][3] = 255
ax1.clear()
ax1.imshow( img )
e2 = cv.getTickCount()
elapsed = ( e2 - e1 ) / cv.getTickFrequency()
print( "FPS: %.2f, Used time: %.3f" % (1 / elapsed, elapsed )) a = animation.FuncAnimation( fig, animateFromData, interval=30 ) # 这里不要省略掉 a = 这个赋值操作
plt.tight_layout()
plt.subplots_adjust(left=0, right=1, top=1, bottom=0)
plt.xticks([])
plt.yticks([])
plt.show()
except StopIteration:
pass
finally:
f.close()

和第 1 部分稍有不同的是,我们显示每帧图片的代码是在 animateFromData 函数中执行的,使用 matplotlib.animation.FuncAnimation 函数循环读取每帧数据(给这个函数传递的 interval = 30 这个没有作用,因为处理速度跟不上)。另外值得注意的是不要省略掉 a = animation.FuncAnimation( fig, animateFromData, interval=30 ) 这一行的赋值操作,虽然不太清楚原理,但是当我把 a = 删掉的时候,程序莫名的无法正常工作了。

控制台中显示的处理速度:

Python 读取图像文件的性能对比

由于对 matplotlib 的了解不多,最开始我以为是 matplotlib 显示图像过慢导致了帧率上不去,打印出代码的用时后发现不是 matplotlib 的问题。因此我也使用了 PyQt5 对图像进行显示,结果依然是 1~2 帧的处理速度。因为只是换用了 Qt 的界面进行显示,逻辑处理的代码依然沿用的 matplotlib.animation 提供的方法,所以并没有本质上的区别。这段用 Qt 显示图片的代码来自于 github matplotlib issue,我对其进行了一些适配。

使用 Numpy 的数组处理 api

我们知道,显示图片这么慢的原因就是在于 Python 处理 2096 * 150 这个两层循环占用了大量时间。接下来我们换用一种 numpyreshape 方法将文件中的像素数据读取到内存中。注意 reshape 方法接收一个 ndarray 对象。我这种每帧数据创造一个 ndarray 数组的方法可能会存在内存泄漏的风险,实际上可以调用一个 ndarray 数组对象的 reshape 方法。这里不再深究。

重新定义一个用于动态显示图片的函数 optAnimateFromData,将其作为参数传递个 FuncAnimation

def optAnimateFromData(i):
e1 = cv.getTickCount()
frame = next( records ) # one image data
img = np.reshape( np.array( list( frame ), dtype = np.uint8 ), ( HEIGHT, WIDTH, CHANNELS ) )
img[ : , : , 3] = 255
ax1.clear()
ax1.imshow( img )
e2 = cv.getTickCount()
elapsed = ( e2 - e1 ) / cv.getTickFrequency()
print( "FPS: %.2f, Used time: %.3f" % (1 / elapsed, elapsed )) a = animation.FuncAnimation( fig, optAnimateFromData, interval=30 )

效果如下,可以看到使用 numpyreshape 方法后,处理用时大幅减少,帧率可以达到 8~9 帧。然而经过优化后的处理速度仍然是比较慢的:

Python 读取图像文件的性能对比

优化过的代码执行结果

使用 Numpy 提供的 memmap

在用 Python 进行机器学习的过程中,发现如果完全使用 Python 的话,很多运算量大的程序也是可以跑的起来的,所以我确信可以用 Python 解决我的这个问题。在我不懈努力下找到 Numpy 提供的 memmap api,这个 API 以数组的方式建立硬盘文件到内存的映射,使用这个 API 后程序就简单一些了:

cv.namedWindow("file")
count = 0
start = time.time()
try:
number = 1
while True:
e1 = cv.getTickCount()
img = np.memmap(filename=FILE_NAME, dtype=np.uint8, shape=SHAPE, mode="r+", offset=count )
count += PACK_SIZE
cv.imshow( "file", img )
e2 = cv.getTickCount()
elapsed = ( e2 - e1 ) / cv.getTickFrequency()
print("FPS: %.2f Used time: %.3f" % (number / elapsed, elapsed ))
key = cv.waitKey(20)
if key == 27: # exit on ESC
break
except StopIteration:
pass
finally:
end = time.time()
print( 'File Data read: {:.2f}Gb'.format( count / 1024 / 1024 / 1024), ' time used: {:.2f}s'.format( end - start ) )
cv.destroyAllWindows()

将 memmap 读取到的数据 img 直接显示在窗口中 cv.imshow( "file", img),每一帧打印出显示该帧所用的时间,最后显示总的时间和读取到的数据大小:

Python 读取图像文件的性能对比

执行效率最高的结果

Python 读取图像文件的性能对比

读取速度非常快,每帧用时只需几毫秒。这样的处理速度完全可以满足 60FPS 的需求。

总结

Python 语言写程序非常方便,但是原生的 Python 代码执行效率确实不如 C++,当然了,比 JS 还是要快一些。使用 Python 开发一些性能要求高的程序时,要么使用 Numpy 这样的库,要么自己编写一个 C 语言库供 Python 调用。在实验过程中,我还使用 Flask 读取文件后以流的形式发送的浏览器,让浏览器中的 JS 文件进行显示,不过同样存在着很严重的性能问题和内存泄漏问题。这个过程留到之后再讲。

本文中的相应代码可以在 github 上查看。

Reference

  1. functools partial
  2. opencv
  3. matplotlib animation
  4. numpy
  5. numpy reshape
  6. memmap
  7. matplotlib issue on github
  8. C 语言扩展
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