这里以配置1个站点（1个域名）为例，n 个站点可以相应增加调整，

假设：
IP地址: 127.0.0.1
域名1 phpmyadmin.zhengwen.cn 放在 /www/phpmyadmin.zhengwen.cn

配置 nginx virtual hosting 的基本思路和步骤如下：
把站点 phpmyadmin.zhengwen.cn 放到 nginx 可以访问的目录 /www/
给每个站点分别创建一个 nginx 配置文件 phpmyadmin.zhengwen.cn.conf,
并把配置文件放到 /etc/nginx/vhosts/
然后在 /etc/nginx.conf 里面加一句 include 把步骤2创建的配置文件全部包含进来（用 * 号）
重启 nginx

具体过程 
下面是具体的配置过程：
1、在 /etc/nginx 下创建 vhosts 目录

mkdir /etc/nginx/vhosts

2、在 /etc/nginx/vhosts/ 里创建一个名字为 phpmyadmin.zhengwen.cn.conf 的文件，把以下内容拷进去

server{
    listen 80;
    server_name phpmyadmin.zhengwen.cn;
    access_log /www/phpmyadmin.zhengwen.cn.log main;
    location /{
        root /www/phpmyadmin.zhengwen.cn;
        index index.php default.php index.html;
    }
    error_page 500 502 503 504 /50x.html;
    location =/50x.html {
        root /usr/share/nginx/html;
    }
    # pass the PHP scripts to FastCGI server listening on 127.0.0.1:9000
    location ~\.php$ {
        fastcgi_pass 127.0.0.1:9000;
        fastcgi_index index.php;
        fastcgi_param SCRIPT_FILENAME /www/phpmyadmin.zhengwen.cn/$fastcgi_script_name;
        include fastcgi_params;
    }
    location ~/\.ht {
        deny all;
    }
}

3、打开/etc/nginx/conf.d/default.conf 文件，在相应位置加入 include 把以上1个文件包含进来

# main server config
http {
        include       mime.types;
        default_type  application/octet-stream;
        log_format  main  '$remote_addr - $remote_user [$time_local] $request '
                      '"$status" $body_bytes_sent "$http_referer" '
                      '"$http_user_agent" "$http_x_forwarded_for"';
        sendfile        on;
        #tcp_nopush     on;
        #keepalive_timeout  0;
        keepalive_timeout  65;
        gzip  on;
        server {
                listen         80;
                server_name     _;
                access_log      /var/log/nginx/access.log main;
                server_name_in_redirect  off;
                location / {
                        root  /usr/share/nginx/html;
                        index index.html;
                }
        }
    # 包含所有的虚拟主机的配置文件
    include /usr/local/etc/nginx/vhosts/*;
}

4、重启 Nginx

/etc/init.d/nginx restart

参考：http://www.server110.com/nginx/201309/981.html