警告: [SetPropertiesRule] Setting property 'source' to 'org.eclipse.jst.jee.server:project' did not find a matching property. 

出现SetPropertiesRule警告的原因是因为Tomcat在server.xml的Context节点中不支持source属性：<Context docBase="…" path="/…" source="org.eclipse.jst.j2ee.server:…"/> 

解决方法是在Servers视图里双击创建的server，然后在其server的配置界面中选中"Publish module contexts to separate XML files"选项。 

不过"Publish module contexts to separate XML files"究竟是什么意思：就是将contexts 部分放到一个单独的文件中。

关于解决方法，再详细说明一下：

Servers视图的打开方法：Window--Show View-other..--Servers

双击Server：就是双击服务器名，我的服务器名为：Tomcat v6.0 Server at localhost 即双击它，进入

server的配置界面： 选中"Publish module contexts to separate XML files"选项